单细胞高通量检测系统技术参数(进口1套,国家医学检验临床医学研究中心)
一 主要技术参数
1、可满足如下科研需求:大型全基因组测序(人、动物)、小型全基因组测序(微生物、病毒)、外显子组和大Panel测序、靶向基因测序、单细胞图谱分析、转录组测序、靶向基因表达图谱分析、miRNA和microRNA分析、DNA-蛋白质相互作用分析(ChIP-Seq)、染色质分析(ATAC-Seq)、*基化测序、16S宏基因组测序、宏基因组分析、游离核酸测序和液体活检分析等。
★2、基于可逆终止子边合成边测序两色荧光标记的测序技术,每次读取一个碱基的荧光反应信号。
3、需采用蓝、绿双通道测序,只需两个图像即可对四种DNA碱基的数据进行编码。
4、多激光系统,双激光通道用于激发荧光基团,第三道激光用于聚焦追踪,波长分别是449 nm、523 nm、820 nm。
5、双面成像,能处理流动槽上表面和下表面的簇。
6、具备纳米井簇生成技术,具备排他性信号扩增技术。
★7、单套试剂单次反应最大可产出≥1200 M个序列的信息,单次反应可生成≥3600亿(360 G)碱基数据。
8、配套提供≥3种输出读数(reads数)流动槽试剂,提供≥8种不同规格的流动槽的配套试剂。
9、测序读长:50 bp、100 bp、200 bp、300 bp、600 bp可选。
10、支持单端读取序列和双端读取序列。
11、单端读取序列,读长≥150个碱基;双端读取序列:读长≥2×150个碱基。
12、模板扩增和测序过程(2×50 bp)最短时间≤13小时。
13、可在2天时间内完成一个人的全基因组测序(30×覆盖度)。
14、采用高密度芯片流动槽,密度≥600万簇/平方毫米。
★15、测序结果给出严格的Q30质量数据,≥2×50 bp测序的质量值Q30≥90%,2×100 bp测序的质量值Q30≥85%,2×150 bp测序的质量值Q30≥85%,2×300 bp测序的质量值Q30≥80%。
★16、集成式卡盒式试剂为全封闭检测室,内含试剂、检测液路和废液容器。
17、卡盒式耗材无需自行配置、混合任何试剂。
18、文库建完后,无需额外操作(包括变性),可直接上机进行文库扩增和测序。
19、试剂槽即插即用,具备可读取的无线射频识别标签。
20、试剂卡盒的多个塑料部件能与废弃物分离,可循环使用。
★21、测序仪可一站式自动完成样本文库克隆扩增、测序和一级、二级数据分析。
22、模板扩增和测序在同一台仪器上自动完成。
23、集成控制软件,并提供界面用于配置系统、设置测序运行以及在测序过程中监控运行统计信息。
24、触摸屏显示器,可直接进行仪器设置以及测序参数设置。
25、内置仪器状态和错误检测传感器。
26、在测序过程中,数据分析软件可进行实时图像分析、碱基检出以及不同样本间的数据拆分。
27、提供多种形式的标准化数据格式(例如FASTQ、BAM、VCF和*.txt),确保数据能与第三方的下游分析和可视化工具兼容。
28、机载生物信息学分析软件采用优化的硬件加速算法,用于各种基因组分析解决方案,包括BCL到FASTQ转换、基因组定位、序列比对、序列排序、重复标记和变异检出等。
29、测序仪机载基因组分析加速器提供≥4种分析管道,如:Germline分析管道,RNA-Seq分析管道等。
30、测序仪主机内置优化的单细胞测序RNA分析流程,仪器可直接分析并获得单细胞测序数据的Matrix文件,用于下游的降维分析和可视化分析。
31、支持在本地或云端进行数据分析。
32、支持在进行一个运行的二级分析的同时开始另一个测序。
33、可在多种LIMS系统中自动追踪测序运行步骤,包括结果报告。
★34、测序仪内不含液流流路,测序前后均无需洗涤测序仪。
35、仪器控制计算机:内存:≥288 GB,硬盘:≥3.8 TB SSD。
36、仪器输入电压:100 V到240 V交流电,仪器输入频率:50/60 Hz。
37、仪器尺寸:宽×深×高:≤70 cm×70 cm×70 cm。
38、仪器重量≤150 kg。
★二 配置
1、测序系统主机1套。
2、电线组件1套。
3、多激光光学系统1套。
4、试剂卡盒结构模块1套。
5、仪器控制计算机1套(内存:≥288 GB,硬盘:≥3.8 TB SSD,CPU:不低于Intel Xeon Silver 4210, GPU:≥2 G)。
6、成像单元1套。
7、冷却单元1套。
8、集成式显示器1套。
9、仪器控制软件1套。
10、数据分析软件1套。
11、生物信息学分析软件1套。
12、仪器配套装机试剂1套。
13、实验室信息管理系统1套。
三 售后服务
★1、整机免费质保三年。
3.本项目的特定资格要求:投标人所投产品属于医疗器械的,须提供医疗器械经营许可证(或医疗器械经营备案凭证),制造商具有有效期内的医疗器械生产许可证(进口设备无须提供),所投产品具有有效期内的医疗器械产品注册证(或医疗器械备案凭证);所投产品为非医疗器械的提供非医疗器械情况说明。
(略) 政府采购活动的供应商 (略) 政府采购供应商库的,请详阅辽宁政府采购网 “首页—政策法规”中公布的“政府采购供应商入库”的相关规定,及时办理入库登记手续。填写单位名称、统一社会信用代码和联系人等简要信息,由系统自动开通账号后,即可参与政府采购活动。具体规定详见《关于进一 (略) 政府采购供应商入库程序的通知》(辽财采函〔2020〕198号)。