单分子实时测序分析系统技术参数(进口1套,国家医学检验临床医学研究中心)
一、主要技术参数
1.系统测序获得的高保真序列读长≥25 kbp。
2.最长测序读长≥150 kbp。
3.建库及测序流程不依赖PCR反应,可实现对单分子模板进行测序,无PCR测序误差。
4.采用光学方式读取单个碱基信息,测序时碱基读取错误为随机误差。
5.建库流程采用发夹状接头,测序过程中可进行环形一致性测序。
6.通过环形测序增加测序深度,纠正随机误差。
7.测序时可在单分子内部进行序列矫正,获得准确度≥99%的高保真序列。
★8.文库构建时间≤3小时。
9.测序通量:每个芯片包含≥800万个零模波导小孔。
10.单张芯片连续采集信号时间30-1800分钟。
★11.每张测序芯片可产出≥300 Gb数据。
12.单张芯片可以产出≥400万条质量准确度≥99%的高保真序列。
13.当测序深度达到40×时,序列一致性准确度≥99.99%。
14.可检测到≤0.1%的稀有突变。
15.同聚物区域及串联重复区域的测序数据无系统误差。
16.测序结果不受GC/AT含量和回文序列的影响,能均匀覆盖整个基因组。
17.可通过16S rRNA和18S rRNA基因全长序列测序,进行微生物群落分析,最高分辨率可达菌种水平。
18.16S rRNA基因全长测序:支持对≥192个样本进行混样测序。
19.可对全长转录本直接测序,测序序列无需借助生物信息学软件拼接。
20.通过条形码建库、混样测序的方式,对微生物基因组进行从头测序。
21.测序可以获得完整或极少数空白的基因组图谱及碱基修饰信息。
22.支持长片段串联重复、倒位、易位等结构变异分析。
23.支持人类白细胞抗原长片段靶向测序,提供准确的基因分型信息。
24.支持富含GC/AT的特定区域靶向测序,提供基于基因编辑技术进行无扩增的靶向捕获测序方案。
★25.组装人类基因组准确度≥99.999%。
26.单张芯片支持≥48个微生物单菌混样进行基因组组装。
27.两张芯片支持对基因组大小≤3 Gb的样本进行基因组变异检测,包括单碱基突变、小片段插入、缺失和结构变异等。
28.单张芯片支持≥8个不同组织的样本混样进行全长转录本测序。
29.单张芯片支持≥768重PCR扩增子进行靶向测序。
30.单张芯片支持≥3个低复杂度宏基因组样本进行测序,分辨率可达到菌种水平。
31.单张芯片支持≥1个高复杂度样本进行基因组组装。
32.仪器检测激光器≥2根。
33.可直接生成高保真序列,节省二级数据分析时间。
★34.支持下机数据与二代测序数据混合拼接。
35.仪器控温方式:半导体控温,确保检测系统温度≤22C,试剂温度≤4C。
36.测序主机内置全自动上样系统,单次运行支持≥4张测序芯片。
37.仪器运行后可以进行远程查看测序数据,随时监控实验进展,可进行远程维护。
38.分析软件:
38.1软件可控制仪器操作、图像处理和生成碱基数据文件。
38.2图形化用户操作界面可进行分析程序设置与数据结果监控。
38.3支持开源数据分析软件,可进行基因组从头组装、序列比对、变异位点识别、RNA拼接分析及*基化位点检测分析等。
39.测序过程中试剂和耗材全自动运行,无需人工操作。
40.通过识别测序芯片和试剂盒条码进行耗材跟踪,确保与指定运行参数匹配。
41.仪器内部没有液路系统,无需进行清洗和废液回收。
42.提供包含基因组DNA,cDNA或扩增子测序所需的试剂和耗材、完整的实验流程以及配套分析软件。
★二、配置
1.主机1台:
1.1加样机械臂组 1个。
1.2样品区制冷模块4C 1个。
1.3环境区制冷模块22C 1个。
1.3数据存储模块 1个。
2 .仪器启动安装包1个(包括测序芯片1张、启动试剂盒1盒)。
3.软件1套(包含仪器控制、碱基读取、质量评估、序列比对、序列组装、结果可视化等功能)。
4.全自动汇流排1个。
5.全自动汇流排支架1个。
三 售后服务
★1整机免费质保三年。
3.本项目的特定资格要求:投标人所投产品属于医疗器械的,须提供医疗器械经营许可证(或医疗器械经营备案凭证),制造商具有有效期内的医疗器械生产许可证(进口设备无须提供),所投产品具有有效期内的医疗器械产品注册证(或医疗器械备案凭证);所投产品为非医疗器械的提供非医疗器械情况说明。
(略) 政府采购活动的供应商 (略) 政府采购供应商库的,请详阅辽宁政府采购网 “首页—政策法规”中公布的“政府采购供应商入库”的相关规定,及时办理入库登记手续。填写单位名称、统一社会信用代码和联系人等简要信息,由系统自动开通账号后,即可参与政府采购活动。具体规定详见《关于进一 (略) 政府采购供应商入库程序的通知》(辽财采函〔2020〕198号)。